Αν και οι βιομηχανικοί υπολογιστές και οι κεντρικοί ελεγκτές είναι πολύ παρόμοιοι, εξακολουθούν να υπάρχουν κάποιες διαφορές:

Διαφορετικές χρήσεις: Οι βιομηχανικοί υπολογιστές ελέγχου χρησιμοποιούνται συνήθως για αυτοματοποιημένο έλεγχο και συλλογή και επεξεργασία δεδομένων σε συστήματα βιομηχανικού ελέγχου. Ο κεντρικός ελεγκτής χρησιμοποιείται συνήθως για το κεντρικό σύστημα ελέγχου μεγάλων κτιρίων ή έξυπνων σπιτιών, υπεύθυνος για τον έλεγχο της λειτουργίας ολόκληρου του εξοπλισμού ή συστήματος.

Διαφορετικές δυνατότητες επεξεργασίας: Λόγω της ανάγκης επεξεργασίας δεδομένων σε πραγματικό χρόνο, οι βιομηχανικοί υπολογιστές ελέγχου απαιτούν υψηλότερες δυνατότητες επεξεργασίας και ταχύτερες ταχύτητες απόκρισης. Ωστόσο, ο κεντρικός ελεγκτής συνήθως δεν χρειάζεται να επεξεργάζεται μεγάλες ποσότητες δεδομένων και έλεγχο σε πραγματικό χρόνο, και η ικανότητα επεξεργασίας του είναι σχετικά χαμηλή.

Διαφορετική επεκτασιμότητα: Οι βιομηχανικοί υπολογιστές ελέγχου συνήθως έχουν ισχυρότερη επεκτασιμότητα και μπορούν να προσθέσουν περισσότερες υποδοχές, διεπαφές και μονάδες ανάλογα με τις ανάγκες. Ο κεντρικός ελεγκτής είναι συνήθως σχετικά σταθερός, έχει αδύναμη επεκτασιμότητα και σπάνια έχει την ευκαιρία αναβάθμισης.

Διαφορετικά περιβάλλοντα εργασίας: Οι βιομηχανικοί υπολογιστές χρησιμοποιούνται συνήθως σε σκληρά βιομηχανικά περιβάλλοντα που απαιτούν υψηλότερη ανθεκτικότητα και αξιοπιστία, ενώ οι κεντρικοί ελεγκτές χρησιμοποιούνται πιο συχνά σε σταθερά περιβάλλοντα όπως σπίτια ή γραφεία.

Διαφορετικές διαμορφώσεις υλικού: Οι βιομηχανικοί υπολογιστές ελέγχου συνήθως έχουν αυστηρότερες απαιτήσεις διαμόρφωσης υλικού, απαιτώντας χαρακτηριστικά όπως αντίσταση σε ηλεκτρομαγνητικές παρεμβολές, προστασία από σκόνη, αδιαβροχοποίηση και αντοχή σε κραδασμούς. Ωστόσο, ο κεντρικός ελεγκτής συνήθως δεν απαιτεί αυτά τα χαρακτηριστικά.